Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNS3Q68CZ2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms