Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDZK1Q5T2W1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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