Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD3Q5T2D3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms