Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms