Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms