Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms