Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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