Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms