Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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