Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms