Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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