Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF2Q15853 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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