Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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