Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms