Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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