Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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