Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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