Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms