Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms