Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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