Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNB1Q14721 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNB1Q14721 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms