Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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