Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD11Q14690 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms