Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms