Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA5AQ13591 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms