Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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