Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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TUBB3Q13509 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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TUBB3Q13509 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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TUBB3Q13509 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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TUBB3Q13509 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBB3Q13509 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBB3Q13509 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBB3Q13509 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBB3Q13509 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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