Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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