Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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