Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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