Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME3Q13232 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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