Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
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