Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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