Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LCP2Q13094 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms