Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms