Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM32Q13049 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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