Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GRIK3Q13003 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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