Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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