Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TROQ12816 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TROQ12816 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TROQ12816 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TROQ12816 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TROQ12816 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TROQ12816 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TROQ12816 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TROQ12816 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TROQ12816 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TROQ12816 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TROQ12816 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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