Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms