Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms