Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms