Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms