Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNDQ07001 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms