Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms