Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUCB1Q02818 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUCB1Q02818 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms