Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms