Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms