Protein–RNA interactions for Protein: P98179

RBM3, RNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3P98179 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RBM3P98179 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RBM3P98179 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RBM3P98179 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RBM3P98179 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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