Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB1P82279 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB1P82279 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms